55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0567 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  100 
 
 
587 aa  1178    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  49.46 
 
 
596 aa  482  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  34.9 
 
 
599 aa  312  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  34.68 
 
 
560 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  36.61 
 
 
814 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  35.41 
 
 
515 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  34.32 
 
 
564 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  35.02 
 
 
593 aa  234  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  31.57 
 
 
587 aa  226  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  32.91 
 
 
586 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  31.09 
 
 
588 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  32.15 
 
 
576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  32.92 
 
 
583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  30.52 
 
 
583 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  30.8 
 
 
609 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  28.99 
 
 
584 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  34 
 
 
547 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 
607 aa  187  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  30.76 
 
 
608 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  30.33 
 
 
655 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  29.09 
 
 
615 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  28.4 
 
 
605 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  32.54 
 
 
601 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 
527 aa  137  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 
594 aa  134  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
647 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  32.07 
 
 
355 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
618 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  30.03 
 
 
594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  25.34 
 
 
609 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 
562 aa  94.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  23.83 
 
 
550 aa  90.9  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  22.85 
 
 
547 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 
596 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  22.73 
 
 
543 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 
546 aa  80.5  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 
561 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 
589 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  25.05 
 
 
677 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  25.64 
 
 
636 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  25.16 
 
 
283 aa  57  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 
559 aa  51.6  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  20.27 
 
 
565 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  24.62 
 
 
688 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  24.91 
 
 
685 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  24.91 
 
 
685 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.66 
 
 
851 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  25.37 
 
 
640 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  30.89 
 
 
368 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  29.87 
 
 
808 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  24.7 
 
 
514 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  23.77 
 
 
534 aa  43.9  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  22.67 
 
 
570 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>