73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3212 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  100 
 
 
514 aa  1020    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  49.24 
 
 
534 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  45.54 
 
 
559 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  47.14 
 
 
547 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  43.54 
 
 
536 aa  346  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1600  von Willebrand factor type A  34.97 
 
 
481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.261392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  29.26 
 
 
513 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  31.09 
 
 
522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  30.43 
 
 
380 aa  90.9  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 
546 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  26 
 
 
607 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  24.4 
 
 
547 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  24.31 
 
 
562 aa  77.4  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  24.34 
 
 
543 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 
562 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  26.72 
 
 
601 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  26.02 
 
 
609 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 
618 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  24.73 
 
 
605 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  24.74 
 
 
570 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  21.85 
 
 
550 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  24.62 
 
 
561 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 
589 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  24.84 
 
 
594 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 
412 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.17 
 
 
712 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.46 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  30 
 
 
412 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  25.18 
 
 
583 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  29.01 
 
 
744 aa  53.9  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  25.89 
 
 
426 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  23.04 
 
 
573 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  25.52 
 
 
515 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  24.94 
 
 
596 aa  50.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  27.74 
 
 
427 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.95 
 
 
751 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  27.13 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.02 
 
 
755 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  33.08 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  30.16 
 
 
942 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 
698 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  31.5 
 
 
776 aa  48.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.57 
 
 
760 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  24.18 
 
 
547 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  25.82 
 
 
571 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  30.77 
 
 
651 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
418 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
418 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  31.09 
 
 
651 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  26.97 
 
 
739 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 
588 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  29.28 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 
592 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.84 
 
 
643 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  29.81 
 
 
490 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 
393 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  30.16 
 
 
224 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  22.35 
 
 
647 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  28.41 
 
 
757 aa  44.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  25 
 
 
583 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  27.22 
 
 
582 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 
527 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  30.2 
 
 
579 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
594 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 
328 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  25.28 
 
 
421 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.41 
 
 
672 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 
587 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.71 
 
 
723 aa  43.5  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 
421 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
814 aa  43.5  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>