44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4074 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  699    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  31.46 
 
 
560 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  33.24 
 
 
587 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 
599 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 
587 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  31.19 
 
 
584 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  29.43 
 
 
814 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  27.81 
 
 
596 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 
564 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  26.52 
 
 
609 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  30.12 
 
 
515 aa  92.8  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  33.22 
 
 
586 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  29.7 
 
 
588 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  26.77 
 
 
594 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 
607 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  25.8 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
615 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.3 
 
 
583 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  25.62 
 
 
605 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  26.33 
 
 
583 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  24.55 
 
 
576 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  31.06 
 
 
593 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  24.45 
 
 
583 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  22.73 
 
 
601 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  21.84 
 
 
547 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  21.36 
 
 
543 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  26.59 
 
 
608 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 
618 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  21.82 
 
 
546 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 
562 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
547 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  22.87 
 
 
562 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  20.11 
 
 
550 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  33.06 
 
 
596 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  34.65 
 
 
677 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  35.96 
 
 
594 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  34.29 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  27.07 
 
 
561 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  27.15 
 
 
283 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  21.02 
 
 
647 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  33.96 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0259  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  24.75 
 
 
345 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.904874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1303  molybdate transporter periplasmic protein  26.17 
 
 
257 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  26.95 
 
 
688 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>