139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1514 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  53.92 
 
 
607 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  56.09 
 
 
605 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  58.56 
 
 
601 aa  656    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1201    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  51.88 
 
 
609 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  52.28 
 
 
583 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  45.56 
 
 
618 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  33.1 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  33.89 
 
 
561 aa  274  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  33.39 
 
 
562 aa  267  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 
550 aa  266  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  34.76 
 
 
543 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  32.26 
 
 
546 aa  263  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  32.28 
 
 
547 aa  263  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  33.51 
 
 
647 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  34.31 
 
 
608 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 
814 aa  176  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  30.76 
 
 
655 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  29.49 
 
 
587 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 
564 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  27.75 
 
 
596 aa  156  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  27.2 
 
 
576 aa  153  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 
615 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  28.13 
 
 
515 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  29.55 
 
 
588 aa  150  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  27.09 
 
 
583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  27.46 
 
 
584 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
609 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  38.87 
 
 
547 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 
583 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  30.4 
 
 
593 aa  130  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  26.59 
 
 
586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  25.64 
 
 
596 aa  127  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  30.38 
 
 
587 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  26.31 
 
 
599 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  31.94 
 
 
594 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  29.47 
 
 
570 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  35.06 
 
 
527 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
589 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  31.62 
 
 
560 aa  97.8  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  25.7 
 
 
414 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  25.7 
 
 
534 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  25.46 
 
 
522 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.72 
 
 
851 aa  87  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  25.38 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  25.63 
 
 
536 aa  84.7  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  24.3 
 
 
547 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  24.04 
 
 
559 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  24.84 
 
 
514 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  25.21 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  23.06 
 
 
677 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  26.14 
 
 
636 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  30.96 
 
 
892 aa  60.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 
847 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  30.36 
 
 
851 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  34.9 
 
 
2887 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  31.69 
 
 
828 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
842 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1600  von Willebrand factor type A  26.58 
 
 
481 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.261392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  23.82 
 
 
387 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  28.65 
 
 
1215 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  28.65 
 
 
1215 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 
418 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.93 
 
 
1215 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  27.93 
 
 
1215 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  27.93 
 
 
1215 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
327 aa  54.3  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.81 
 
 
786 aa  54.3  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
888 aa  53.9  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 
902 aa  53.9  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 
380 aa  53.5  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 
579 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.18 
 
 
760 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
418 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  24.77 
 
 
307 aa  52.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  31.11 
 
 
626 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.22 
 
 
451 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 
421 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  30.39 
 
 
951 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  26.85 
 
 
331 aa  51.2  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  24.74 
 
 
412 aa  51.2  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 
966 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  28.89 
 
 
582 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  26.11 
 
 
380 aa  50.8  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  30.1 
 
 
490 aa  50.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.59 
 
 
791 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  25.71 
 
 
315 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.81 
 
 
442 aa  49.7  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.18 
 
 
755 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25 
 
 
643 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.06 
 
 
416 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
972 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.27 
 
 
732 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  21.04 
 
 
573 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.46 
 
 
680 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.65 
 
 
751 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.72 
 
 
712 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  28.29 
 
 
914 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  21.25 
 
 
394 aa  48.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0945  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 
2166 aa  48.5  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.775742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>