51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1261 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  100 
 
 
814 aa  1630    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  48.15 
 
 
586 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  45.45 
 
 
515 aa  445  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  37.33 
 
 
599 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  37.72 
 
 
587 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  35.91 
 
 
596 aa  317  5e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  33.91 
 
 
560 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  33.75 
 
 
587 aa  279  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  34.03 
 
 
583 aa  261  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  31.55 
 
 
584 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  35.54 
 
 
564 aa  257  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  32.07 
 
 
576 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  31.44 
 
 
608 aa  228  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  31.83 
 
 
583 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  29.73 
 
 
609 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  32.32 
 
 
593 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  32.46 
 
 
547 aa  211  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  30.24 
 
 
615 aa  207  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 
588 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  29.53 
 
 
605 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  30.9 
 
 
607 aa  196  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  28.04 
 
 
594 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 
583 aa  169  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  28.52 
 
 
594 aa  165  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  27.58 
 
 
601 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 
618 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 
609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  26.69 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  34.31 
 
 
655 aa  118  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  28.12 
 
 
355 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  23.13 
 
 
647 aa  104  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  23.78 
 
 
596 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  24.96 
 
 
543 aa  97.8  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  29.15 
 
 
561 aa  94.7  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  23.13 
 
 
546 aa  89  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.19 
 
 
562 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  24.19 
 
 
547 aa  85.1  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  26.14 
 
 
562 aa  84.3  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  24.95 
 
 
677 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  23.77 
 
 
550 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 
559 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  23.77 
 
 
688 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  23.58 
 
 
685 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  23.58 
 
 
685 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  23.03 
 
 
636 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  27.44 
 
 
640 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  25.39 
 
 
589 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  30.16 
 
 
224 aa  52.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  26.37 
 
 
859 aa  51.6  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 
547 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  32.69 
 
 
368 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>