15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  41.26 
 
 		 596 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  33.11 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  30 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  35.16 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  34.65 
 
 		 688 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  34.65 
 
 		 685 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  34.65 
 
 		 685 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  35.03 
 
 		 636 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  37.82 
 
 		 564 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  32.65 
 
 		 814 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  32.31 
 
 		 677 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  36.17 
 
 		 640 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 576 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 		 608 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>