110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3957 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  100 
 
 
618 aa  1243    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  50.16 
 
 
607 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  48.62 
 
 
605 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  45.56 
 
 
594 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  46.83 
 
 
609 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  46.42 
 
 
601 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  47.41 
 
 
583 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  35.43 
 
 
647 aa  296  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  33.56 
 
 
543 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  32.3 
 
 
547 aa  290  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
550 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  32.99 
 
 
561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  32.09 
 
 
562 aa  272  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  32.46 
 
 
546 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  33.08 
 
 
562 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  30.76 
 
 
608 aa  207  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  28.2 
 
 
564 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  27.79 
 
 
609 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  30.2 
 
 
655 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 
583 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 
814 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 
576 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 
615 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  25.57 
 
 
596 aa  122  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 
596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  25.72 
 
 
587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  28.87 
 
 
414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 
589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 
547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
587 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 
593 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  28.23 
 
 
570 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  27.51 
 
 
414 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 
515 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  24.57 
 
 
584 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 
599 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  23.8 
 
 
560 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 
588 aa  97.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  29 
 
 
583 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 
586 aa  91.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  24.68 
 
 
559 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  28.05 
 
 
387 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  24.95 
 
 
534 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  23.76 
 
 
522 aa  84.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.44 
 
 
851 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  24.42 
 
 
547 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  24.26 
 
 
536 aa  75.1  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 
594 aa  73.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  22.57 
 
 
513 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 
514 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  28.88 
 
 
851 aa  70.5  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  25.23 
 
 
677 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 
527 aa  65.1  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.35 
 
 
643 aa  60.8  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
842 aa  60.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  28.7 
 
 
368 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0752  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
678 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  26.69 
 
 
847 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 
393 aa  57.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  25.98 
 
 
355 aa  57.4  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  20.88 
 
 
573 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  32.79 
 
 
966 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  24.93 
 
 
688 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.1 
 
 
416 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
419 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  26.45 
 
 
490 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  25.67 
 
 
636 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  24.48 
 
 
316 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  30.43 
 
 
523 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.15 
 
 
442 aa  51.6  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 
859 aa  51.2  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  25.07 
 
 
685 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  25.07 
 
 
685 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  27.87 
 
 
888 aa  50.4  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  31.12 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
418 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  21.25 
 
 
394 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
477 aa  48.9  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  27.38 
 
 
436 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 
571 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 
717 aa  48.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
412 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 
427 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
308 aa  47.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  28.24 
 
 
283 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  26.46 
 
 
328 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  26.91 
 
 
328 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2192  hypothetical protein  23.26 
 
 
371 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
808 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  22.22 
 
 
317 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  29.27 
 
 
936 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  25.84 
 
 
334 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  32.69 
 
 
914 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
344 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  25 
 
 
315 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.5 
 
 
420 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  26.96 
 
 
459 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  30.32 
 
 
828 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 
480 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>