27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1968 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  100 
 
 
513 aa  1038    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  36.87 
 
 
522 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  30.24 
 
 
547 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 
514 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  30.17 
 
 
534 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  28 
 
 
559 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  28.29 
 
 
536 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  38.31 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1600  von Willebrand factor type A  23.26 
 
 
481 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.261392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  24.51 
 
 
562 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  23.29 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  22.7 
 
 
550 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  26.21 
 
 
547 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  22.57 
 
 
618 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
543 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  24.93 
 
 
570 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  23.31 
 
 
546 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  22.43 
 
 
561 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  22.6 
 
 
583 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  23.24 
 
 
589 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  23.79 
 
 
605 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  22.65 
 
 
607 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  23.47 
 
 
609 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  21 
 
 
601 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.75 
 
 
725 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4714  thiosulphate-binding protein  24.26 
 
 
381 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217544  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 
918 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>