36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1580 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  100 
 
 
522 aa  1066    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  36.87 
 
 
513 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  32.7 
 
 
547 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  31.34 
 
 
534 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  31.26 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 
559 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  29.56 
 
 
536 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  41.18 
 
 
380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  27.63 
 
 
605 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  25.96 
 
 
570 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  25 
 
 
607 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  25.77 
 
 
609 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  25.61 
 
 
546 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 
562 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1600  von Willebrand factor type A  24.6 
 
 
481 aa  86.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
589 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 
583 aa  85.1  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  23.76 
 
 
618 aa  84.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  24.68 
 
 
550 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 
562 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  24.96 
 
 
561 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  25.46 
 
 
594 aa  77  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 
547 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  22.82 
 
 
601 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 
543 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  24.13 
 
 
564 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.6 
 
 
421 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  23.44 
 
 
596 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  21.63 
 
 
647 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.74 
 
 
643 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  33.86 
 
 
847 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  21.33 
 
 
420 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 
393 aa  44.3  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  23.6 
 
 
903 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  20.67 
 
 
419 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 
583 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>