50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0766 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 536 aa  1056    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  43.54 
 
 		 514 aa  347  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  41.12 
 
 		 534 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  41.54 
 
 		 547 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  39.07 
 
 		 559 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  29.56 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1600  von Willebrand factor type A  33.47 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.261392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 		 513 aa  158  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 		 562 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  23.56 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  27.31 
 
 		 561 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  27.27 
 
 		 605 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  24.78 
 
 		 550 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  23.86 
 
 		 546 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 		 547 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  25.84 
 
 		 609 aa  90.9  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 		 601 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  26.53 
 
 		 543 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  31.8 
 
 		 380 aa  87.4  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  26.28 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 583 aa  81.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 		 607 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  24.74 
 
 		 589 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  24.26 
 
 		 618 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  25.63 
 
 		 594 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  25.44 
 
 		 570 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  33.56 
 
 		 1077 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  36.96 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  35.82 
 
 		 942 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 		 564 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  28.96 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  26.42 
 
 		 565 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.02 
 
 		 740 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  28.65 
 
 		 412 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.07 
 
 		 583 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  27.42 
 
 		 571 aa  45.8  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 592 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.89 
 
 		 753 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.36 
 
 		 418 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  27.68 
 
 		 739 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.98 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 654 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.06 
 
 		 680 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  33.85 
 
 		 776 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 599 aa  44.3  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  24.3 
 
 		 892 aa  44.3  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  26.6 
 
 		 560 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>