35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2800 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  842    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  81.88 
 
 		 414 aa  691    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  37.11 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  34.4 
 
 		 561 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  35.88 
 
 		 562 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2192  hypothetical protein  35.35 
 
 		 371 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  31.62 
 
 		 562 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 		 547 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  31.66 
 
 		 543 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  30.63 
 
 		 546 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 		 550 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 618 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  26.13 
 
 		 594 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 		 601 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  26.4 
 
 		 607 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  32.12 
 
 		 583 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  28.08 
 
 		 609 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0753  hypothetical protein  27.91 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0308132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.49 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1361  hypothetical protein  26.56 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00218567  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  33.96 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  29.69 
 
 		 570 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 647 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  24.04 
 
 		 609 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  25.41 
 
 		 536 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1132  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.14 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2844  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  32.98 
 
 		 355 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000416569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0259  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  27.74 
 
 		 345 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.904874  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1582  hypothetical protein  27.18 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1071  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic solute-binding protein  26.44 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1681  thiosulphate-binding protein  29.21 
 
 		 350 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235432  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1390  thiosulphate-binding protein  26.44 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  29.3 
 
 		 332 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  32.45 
 
 		 337 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3174  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  32.29 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>