34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2578 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  844    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  81.88 
 
 		 414 aa  689    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  34.88 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2192  hypothetical protein  34.54 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  35.19 
 
 		 562 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  35.64 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  30.51 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  30.69 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  30.75 
 
 		 543 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  29.02 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 		 550 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  27.06 
 
 		 618 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0753  hypothetical protein  29.57 
 
 		 367 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0308132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1361  hypothetical protein  28.82 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00218567  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 		 583 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  24.68 
 
 		 609 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  26.06 
 
 		 594 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  24.53 
 
 		 607 aa  86.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  25.96 
 
 		 601 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  25.43 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  26.79 
 
 		 570 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 		 589 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 		 647 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  23.72 
 
 		 609 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  21.6 
 
 		 565 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1132  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.16 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1071  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic solute-binding protein  28.24 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1390  thiosulphate-binding protein  28.24 
 
 		 365 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  31.17 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  31.17 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  31.17 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  30.19 
 
 		 332 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1582  hypothetical protein  23.01 
 
 		 368 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  29.56 
 
 		 332 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>