206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2799 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
561 aa  1139    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  87.71 
 
 
562 aa  975    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  50.64 
 
 
562 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  39.19 
 
 
543 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  38.46 
 
 
546 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  38.26 
 
 
547 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  36.78 
 
 
550 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  34.71 
 
 
605 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  35.78 
 
 
607 aa  289  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  32.99 
 
 
618 aa  283  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  33.27 
 
 
609 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  33.64 
 
 
601 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  33.22 
 
 
594 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  34.27 
 
 
583 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  35.16 
 
 
414 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  36.36 
 
 
414 aa  193  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  29.72 
 
 
647 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  31.31 
 
 
570 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  30.59 
 
 
589 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 
608 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  31.41 
 
 
387 aa  144  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 
655 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 
536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  24.57 
 
 
609 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2192  hypothetical protein  30.84 
 
 
371 aa  104  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.57 
 
 
559 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
599 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  26.62 
 
 
534 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  25.22 
 
 
547 aa  95.1  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 
814 aa  94  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  27.11 
 
 
596 aa  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  26.27 
 
 
615 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  25.61 
 
 
564 aa  91.3  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 
522 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  26.02 
 
 
576 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  26.1 
 
 
583 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  27.49 
 
 
593 aa  81.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  23.4 
 
 
573 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  22.76 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  23.65 
 
 
587 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 
583 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  31.35 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  22.43 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  24.92 
 
 
560 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  23.62 
 
 
587 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 
514 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 
571 aa  74.3  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0753  hypothetical protein  25.23 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0308132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  24.6 
 
 
596 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  29.82 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  31.72 
 
 
643 aa  67.4  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  25.37 
 
 
317 aa  67  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  28.25 
 
 
851 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  33.33 
 
 
523 aa  63.5  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 
588 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  20.9 
 
 
584 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 
744 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  31.55 
 
 
888 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  28.92 
 
 
610 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  30.12 
 
 
420 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  29.95 
 
 
334 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.64 
 
 
847 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 
418 aa  60.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  34.81 
 
 
819 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  29.09 
 
 
412 aa  60.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 
462 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  28.05 
 
 
316 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  29.28 
 
 
328 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  29.28 
 
 
328 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  27.27 
 
 
316 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 
547 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  29.48 
 
 
452 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.54 
 
 
505 aa  57.4  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  28.9 
 
 
452 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.25 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  33.73 
 
 
717 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  29.57 
 
 
755 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  31.67 
 
 
411 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  29.35 
 
 
739 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 
315 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  29.82 
 
 
421 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 
419 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2506  von Willebrand factor, type A  24.24 
 
 
362 aa  54.3  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  30.29 
 
 
321 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.81 
 
 
772 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  26.87 
 
 
344 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1222  von Willebrand factor, type A  33.08 
 
 
888 aa  53.9  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.19 
 
 
770 aa  53.9  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.25 
 
 
771 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  28.34 
 
 
902 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  25.64 
 
 
335 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
335 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 
480 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 
319 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.53 
 
 
412 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.97 
 
 
791 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  28.88 
 
 
761 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  26.53 
 
 
344 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  31.72 
 
 
775 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>