71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1773 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  100 
 
 
316 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.73 
 
 
643 aa  85.9  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.47 
 
 
3027 aa  63.2  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  27.04 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  27.53 
 
 
795 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.05 
 
 
561 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
717 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 
744 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
562 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3344  von Willebrand factor, type A  24.4 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.81 
 
 
459 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  27.91 
 
 
1188 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  23.32 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 
888 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  23.32 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2505  von Willebrand factor, type A  24.66 
 
 
430 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  24.48 
 
 
618 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  25.26 
 
 
317 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  29.8 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  25.95 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  25.12 
 
 
609 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  24.85 
 
 
851 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  26.51 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  32.05 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  24.87 
 
 
715 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  26.19 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  25.82 
 
 
892 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  27.45 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  24.5 
 
 
550 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.73 
 
 
418 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.73 
 
 
418 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 
842 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  23.67 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  23.16 
 
 
625 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  23.43 
 
 
319 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  23.19 
 
 
377 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  23.6 
 
 
777 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1866  von Willebrand factor, type A  23.41 
 
 
628 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.36 
 
 
420 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  24.66 
 
 
593 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  26.56 
 
 
982 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  25.4 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.56 
 
 
418 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
601 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  29.69 
 
 
594 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1710  von Willebrand factor type A  20.74 
 
 
698 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  22.29 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2506  von Willebrand factor, type A  20.93 
 
 
362 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 
373 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  24.61 
 
 
902 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  23.5 
 
 
339 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  25.15 
 
 
972 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  26.55 
 
 
1446 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
515 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  31.58 
 
 
419 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  23.27 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  26.97 
 
 
570 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  20.48 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  20.48 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27 
 
 
336 aa  43.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  27.98 
 
 
613 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 
583 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  23.98 
 
 
490 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  22.75 
 
 
1100 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  25.11 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 
562 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  22.17 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>