52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1059 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 625 aa  1263    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  31.99 
 
 		 787 aa  209  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  27.95 
 
 		 715 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1466  von Willebrand factor, type A  30.59 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2528  von Willebrand factor type A  26.69 
 
 		 622 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03209  hypothetical protein  24.72 
 
 		 416 aa  97.4  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1824  hypothetical protein  22.22 
 
 		 419 aa  92.8  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002774  hypothetical protein  23.86 
 
 		 416 aa  92  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02387  hypothetical protein  29.06 
 
 		 498 aa  91.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000501631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2363  hypothetical protein  29.76 
 
 		 481 aa  90.9  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000015183  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2256  hypothetical protein  27.38 
 
 		 455 aa  90.5  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2397  hypothetical protein  27.27 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1994  hypothetical protein  29.61 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000845172  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2110  hypothetical protein  28.57 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000434469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2064  hypothetical protein  26.43 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000323531  hitchhiker  0.000809606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2016  hypothetical protein  26.43 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000139386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2001  hypothetical protein  26.43 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000125665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1879  hypothetical protein  26.18 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00596429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2322  hypothetical protein  25.99 
 
 		 457 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247486  hitchhiker  0.0000407236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2203  hypothetical protein  25.4 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1781  hypothetical protein  26.79 
 
 		 455 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000015299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2606  hypothetical protein  26.57 
 
 		 438 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000605576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2233  hypothetical protein  25.37 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000634383  normal  0.29326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2156  hypothetical protein  25.37 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000672621  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2557  hypothetical protein  25.37 
 
 		 479 aa  67  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  31.76 
 
 		 982 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2401  hypothetical protein  24.41 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000696992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2364  hypothetical protein  24.37 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000433583  hitchhiker  0.00524599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3011  von Willebrand factor, type A  28.67 
 
 		 774 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0179929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2017  hypothetical protein  22.43 
 
 		 440 aa  54.3  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 		 427 aa  53.9  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.16 
 
 		 3027 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  33.04 
 
 		 777 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1710  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 		 698 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  25.27 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  23.46 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 		 717 aa  48.5  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  26.87 
 
 		 436 aa  47.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3093  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 		 340 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  25.47 
 
 		 855 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  26.98 
 
 		 795 aa  45.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 599 aa  45.8  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  27.64 
 
 		 327 aa  45.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  25.49 
 
 		 334 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 		 562 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 		 1188 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2507  hypothetical protein  28.82 
 
 		 834 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.669353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  26.54 
 
 		 561 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 		 788 aa  43.9  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  22.97 
 
 		 609 aa  43.9  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>