39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1606 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
715 aa  1394    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  40.05 
 
 
787 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1466  von Willebrand factor, type A  34.12 
 
 
596 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 
625 aa  170  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2528  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 
622 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287943  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03209  hypothetical protein  22.42 
 
 
416 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1824  hypothetical protein  23.56 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2606  hypothetical protein  26.09 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000605576  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2397  hypothetical protein  22.84 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002774  hypothetical protein  23.65 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2110  hypothetical protein  24.29 
 
 
440 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000434469  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1994  hypothetical protein  23.38 
 
 
438 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000845172  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2256  hypothetical protein  24.28 
 
 
455 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2557  hypothetical protein  24.24 
 
 
479 aa  62.4  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2203  hypothetical protein  21.94 
 
 
445 aa  62.4  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1879  hypothetical protein  22.33 
 
 
439 aa  61.6  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00596429  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2363  hypothetical protein  23.36 
 
 
481 aa  61.6  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000015183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02387  hypothetical protein  25.12 
 
 
498 aa  57.4  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000501631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2017  hypothetical protein  20.43 
 
 
440 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2156  hypothetical protein  25 
 
 
474 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000672621  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2401  hypothetical protein  23.74 
 
 
444 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000696992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2064  hypothetical protein  22.73 
 
 
457 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000323531  hitchhiker  0.000809606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2233  hypothetical protein  25 
 
 
474 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000634383  normal  0.29326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2322  hypothetical protein  22.73 
 
 
457 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247486  hitchhiker  0.0000407236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2016  hypothetical protein  22.73 
 
 
457 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000139386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2001  hypothetical protein  22.73 
 
 
457 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000125665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
1188 aa  55.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  25.91 
 
 
982 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1781  hypothetical protein  22.27 
 
 
455 aa  53.9  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000015299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 
313 aa  53.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1710  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 
698 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3011  von Willebrand factor, type A  27.47 
 
 
774 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0179929  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 
527 aa  49.7  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2364  hypothetical protein  22.73 
 
 
394 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000433583  hitchhiker  0.00524599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 
316 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  23.97 
 
 
777 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  29.47 
 
 
795 aa  45.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 
427 aa  44.3  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 
436 aa  44.3  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>