28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2363 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2363  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  984    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000015183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02387  hypothetical protein  55.53 
 
 		 498 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000501631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2256  hypothetical protein  40.9 
 
 		 455 aa  316  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2203  hypothetical protein  32.75 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2606  hypothetical protein  32.36 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000605576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1879  hypothetical protein  34.65 
 
 		 439 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00596429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1824  hypothetical protein  31.74 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2110  hypothetical protein  34.53 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000434469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2401  hypothetical protein  31.61 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000696992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2064  hypothetical protein  32.08 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000323531  hitchhiker  0.000809606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2016  hypothetical protein  31.79 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000139386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2322  hypothetical protein  31.79 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247486  hitchhiker  0.0000407236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2001  hypothetical protein  33.99 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000125665  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2017  hypothetical protein  31.7 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1994  hypothetical protein  35.31 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000845172  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2557  hypothetical protein  33.55 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002774  hypothetical protein  31.95 
 
 		 416 aa  163  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1781  hypothetical protein  32.17 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000015299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2156  hypothetical protein  32.82 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000672621  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2233  hypothetical protein  32.82 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000634383  normal  0.29326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03209  hypothetical protein  28.61 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2397  hypothetical protein  32.38 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2364  hypothetical protein  32.76 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000433583  hitchhiker  0.00524599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 		 625 aa  91.3  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  26.77 
 
 		 787 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1466  von Willebrand factor, type A  31.09 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  23.47 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2528  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 622 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>