48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1355 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  100 
 
 		 787 aa  1580    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  40.05 
 
 		 715 aa  288  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1466  von Willebrand factor, type A  35.17 
 
 		 596 aa  220  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  31.99 
 
 		 625 aa  203  9e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2528  von Willebrand factor type A  27.51 
 
 		 622 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2363  hypothetical protein  25.25 
 
 		 481 aa  88.6  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000015183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2606  hypothetical protein  24.33 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000605576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2397  hypothetical protein  25.77 
 
 		 420 aa  72  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03209  hypothetical protein  23.36 
 
 		 416 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02387  hypothetical protein  23.05 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000501631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2401  hypothetical protein  24.52 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000696992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1824  hypothetical protein  23.41 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 		 1188 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002774  hypothetical protein  23.2 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3011  von Willebrand factor, type A  34.45 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0179929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1710  von Willebrand factor type A  25.46 
 
 		 698 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1994  hypothetical protein  22.97 
 
 		 438 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000845172  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2110  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000434469  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2557  hypothetical protein  22.38 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2156  hypothetical protein  22.58 
 
 		 474 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000672621  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2017  hypothetical protein  21.26 
 
 		 440 aa  57  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2233  hypothetical protein  22.76 
 
 		 474 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000634383  normal  0.29326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2256  hypothetical protein  23.94 
 
 		 455 aa  55.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  31.37 
 
 		 982 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2203  hypothetical protein  22.34 
 
 		 445 aa  54.3  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  29.26 
 
 		 966 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  29.21 
 
 		 605 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.4 
 
 		 442 aa  51.6  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2064  hypothetical protein  21.91 
 
 		 457 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000323531  hitchhiker  0.000809606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2016  hypothetical protein  22.22 
 
 		 457 aa  50.8  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000139386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 		 842 aa  50.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2001  hypothetical protein  22.22 
 
 		 457 aa  50.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000125665  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2322  hypothetical protein  21.91 
 
 		 457 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247486  hitchhiker  0.0000407236 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1879  hypothetical protein  22.17 
 
 		 439 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00596429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1781  hypothetical protein  21.92 
 
 		 455 aa  50.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000015299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  25.53 
 
 		 490 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  29.19 
 
 		 643 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  27.16 
 
 		 427 aa  49.3  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  27.5 
 
 		 607 aa  48.9  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 		 474 aa  48.9  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2364  hypothetical protein  22.5 
 
 		 394 aa  47.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000433583  hitchhiker  0.00524599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.48 
 
 		 3027 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 546 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 		 436 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 527 aa  47.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.1 
 
 		 418 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  29.57 
 
 		 972 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>