57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2073 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  92.74 
 
 		 427 aa  759    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 436 aa  859    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  37.76 
 
 		 681 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  36.79 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  29.43 
 
 		 626 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  37.5 
 
 		 477 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  29.88 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  34.76 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  34.55 
 
 		 1356 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  32.29 
 
 		 855 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  32.63 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  32.63 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  26.56 
 
 		 575 aa  59.7  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  32.37 
 
 		 318 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  27.88 
 
 		 581 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.28 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3011  von Willebrand factor, type A  36.7 
 
 		 774 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0179929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  28.57 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  31.46 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  29.3 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  30.04 
 
 		 316 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  28.45 
 
 		 251 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10690  hypothetical protein  27.36 
 
 		 157 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  30 
 
 		 597 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  29.48 
 
 		 605 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  29.11 
 
 		 787 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  32.82 
 
 		 982 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 		 936 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 		 515 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 		 618 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.21 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  24.15 
 
 		 609 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  34.48 
 
 		 777 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  30.09 
 
 		 327 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 		 788 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 		 607 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2880  hypothetical protein  28.05 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  28.45 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 		 715 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  22.28 
 
 		 562 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 313 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  27.35 
 
 		 350 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  23.92 
 
 		 317 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 		 342 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  25.52 
 
 		 1313 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  29.35 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  28.36 
 
 		 320 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  24.78 
 
 		 328 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  27.16 
 
 		 651 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  27.16 
 
 		 651 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.63 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>