43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1795 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  100 
 
 
626 aa  1257    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  32.29 
 
 
681 aa  203  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 
427 aa  127  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  29.52 
 
 
436 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  35.63 
 
 
429 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  33.66 
 
 
504 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  32.49 
 
 
452 aa  111  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  36 
 
 
429 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  32 
 
 
477 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  32.06 
 
 
855 aa  84  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11620  hypothetical protein  27.81 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0466305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  30.94 
 
 
1356 aa  79.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  30.73 
 
 
251 aa  62.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  25.35 
 
 
575 aa  61.6  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
403 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  31.97 
 
 
579 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  39.44 
 
 
401 aa  53.9  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  27.87 
 
 
319 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  28.28 
 
 
334 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  27.91 
 
 
308 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  25.86 
 
 
298 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 
353 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  28.42 
 
 
795 aa  51.6  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 
609 aa  51.2  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  29.94 
 
 
594 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  24.55 
 
 
581 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  27.01 
 
 
345 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  33.59 
 
 
596 aa  48.9  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 
344 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  23.9 
 
 
350 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  25.41 
 
 
607 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  25.77 
 
 
647 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  24.57 
 
 
597 aa  46.2  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10690  hypothetical protein  31.73 
 
 
157 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  26.13 
 
 
914 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  25.53 
 
 
428 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  25.55 
 
 
318 aa  45.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  26.22 
 
 
354 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  28.39 
 
 
345 aa  44.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 
327 aa  44.3  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 
328 aa  43.9  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  25.51 
 
 
335 aa  44.3  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>