48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1539 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1180    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  45.57 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  32.48 
 
 		 403 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  32.53 
 
 		 401 aa  127  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  32.59 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  36.21 
 
 		 575 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2880  hypothetical protein  30.49 
 
 		 423 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  28.22 
 
 		 1356 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  29.45 
 
 		 855 aa  69.7  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2102  putative virulence effector protein  33.63 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  24.05 
 
 		 429 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2381  putative virulence effector protein  33.63 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  34.71 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0471  hypothetical protein  32.76 
 
 		 454 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  27.98 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2093  putative virulence effector protein  32.74 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1435  putative virulence effector protein  34.21 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  24.56 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  34.21 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4240  hypothetical protein  31.9 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0163273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  23.19 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  29.35 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1882  putative virulence effector protein  30.97 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1748  ssrAB activated gene  26.55 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.135386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1773  ssrAB activated gene  26.55 
 
 		 439 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1711  ssrAB activated gene  26.55 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1567  ssrAB activated gene  26.55 
 
 		 439 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1708  ssrAB activated gene  26.55 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0896  hypothetical protein  29.77 
 
 		 421 aa  53.9  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.08458  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  24.57 
 
 		 626 aa  53.9  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  33.04 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0895  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.84 
 
 		 621 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.693546  normal  0.575051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6478  hypothetical protein  30.63 
 
 		 469 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1844  hypothetical protein  30.09 
 
 		 492 aa  50.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2108  ssrAB activated gene  24.78 
 
 		 460 aa  50.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  29.57 
 
 		 317 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  31.62 
 
 		 517 aa  50.4  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  28.86 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4051  hypothetical protein  35.04 
 
 		 418 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749152  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 319 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  27.91 
 
 		 251 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3215  hypothetical protein  26.35 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 319 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  28.32 
 
 		 319 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.95 
 
 		 578 aa  44.3  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 315 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>