21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4158 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 429 aa  847    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  71.79 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  31.92 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  34.87 
 
 		 1356 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  38.2 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  31.73 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  36 
 
 		 626 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  35.71 
 
 		 855 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  33.68 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  32.63 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  30.17 
 
 		 581 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  33.05 
 
 		 681 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  34.03 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 575 aa  66.6  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  31.85 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10690  hypothetical protein  32.61 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  24.05 
 
 		 597 aa  53.5  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 		 418 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 		 579 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>