39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4136 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 461 aa  927    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  42.42 
 
 		 681 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  30.74 
 
 		 855 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  34.55 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  36.36 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  32.98 
 
 		 1356 aa  97.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  31.87 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  31.49 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  34.03 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  28.18 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 		 626 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  30.88 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  31.44 
 
 		 251 aa  69.3  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  26.99 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  28.26 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  30.38 
 
 		 581 aa  61.6  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1755  von Willebrand factor, type A  29.15 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.882145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  25.93 
 
 		 892 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  26.98 
 
 		 335 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  32.79 
 
 		 450 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  29.03 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  27.05 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 		 788 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  28.22 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  27.49 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  28.22 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  28.22 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  24.35 
 
 		 991 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 		 958 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  25.67 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 327 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  34.15 
 
 		 505 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  24.32 
 
 		 308 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  30.3 
 
 		 320 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>