44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3320 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 855 aa  1699    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  33.83 
 
 		 1356 aa  362  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  37.71 
 
 		 477 aa  257  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4065  von Willebrand factor, type A  41.79 
 
 		 422 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 		 461 aa  111  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  39.9 
 
 		 681 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  36.81 
 
 		 429 aa  108  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 		 429 aa  104  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  32.47 
 
 		 251 aa  101  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  33.64 
 
 		 427 aa  98.2  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  34.17 
 
 		 504 aa  95.1  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  32.29 
 
 		 436 aa  89  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  28.49 
 
 		 452 aa  89  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  32.06 
 
 		 626 aa  84.3  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  32.64 
 
 		 575 aa  74.3  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  24.27 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  28 
 
 		 581 aa  67.4  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  29.45 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  27.36 
 
 		 327 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  26.58 
 
 		 543 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 		 308 aa  51.6  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 		 327 aa  51.2  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  25.78 
 
 		 319 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 		 319 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  28.09 
 
 		 648 aa  50.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  26.7 
 
 		 349 aa  49.3  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 		 334 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  25.11 
 
 		 353 aa  48.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  24.75 
 
 		 327 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  25.15 
 
 		 419 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  27.64 
 
 		 335 aa  47.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  21.61 
 
 		 579 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  27.09 
 
 		 319 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 		 315 aa  45.8  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  25.43 
 
 		 547 aa  45.8  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10690  hypothetical protein  26.37 
 
 		 157 aa  45.8  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.66 
 
 		 616 aa  45.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 		 329 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 		 608 aa  45.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  23.08 
 
 		 643 aa  45.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  24.75 
 
 		 315 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  26.64 
 
 		 335 aa  44.3  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>