34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1396 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 504 aa  1017    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  36.23 
 
 		 452 aa  153  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  36.61 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  36.79 
 
 		 436 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  32.28 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  35.5 
 
 		 477 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  31.35 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  33.66 
 
 		 626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  33.99 
 
 		 681 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  32.12 
 
 		 1356 aa  99.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  34.55 
 
 		 855 aa  95.1  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  26.57 
 
 		 401 aa  76.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  27.7 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  32 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  27.78 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  29.27 
 
 		 581 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  29.03 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  28.91 
 
 		 317 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  27.97 
 
 		 319 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2880  hypothetical protein  33.75 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  24.38 
 
 		 607 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  25.33 
 
 		 336 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  25.51 
 
 		 601 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  29.72 
 
 		 527 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  27.35 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  25.29 
 
 		 597 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  27.85 
 
 		 1867 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 418 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  28.21 
 
 		 892 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  31.47 
 
 		 375 aa  43.5  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 418 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  35.48 
 
 		 335 aa  43.5  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>