228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1317 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  40.21 
 
 
313 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  37.66 
 
 
308 aa  165  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  33.02 
 
 
319 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  31.75 
 
 
354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  34.96 
 
 
318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  31.84 
 
 
315 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  32.23 
 
 
319 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  30.38 
 
 
335 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  31.87 
 
 
319 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  29.97 
 
 
335 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  30.03 
 
 
335 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  30.03 
 
 
335 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  30.03 
 
 
335 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  31.95 
 
 
319 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  31.3 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  29.94 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  30.58 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
353 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  29.97 
 
 
335 aa  112  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  28.89 
 
 
321 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
315 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  30.59 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  29.2 
 
 
355 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 
327 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  33.03 
 
 
318 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 
316 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  28.45 
 
 
315 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  30.9 
 
 
358 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  30.17 
 
 
325 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  28.86 
 
 
326 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  27.54 
 
 
351 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  30.59 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  30.96 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 
1188 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.89 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  28.79 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  26.45 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  24.21 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  24.18 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  25.66 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  26.77 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  32.17 
 
 
1446 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  25.73 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  23.69 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  28.25 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  24.67 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  24.35 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  26.44 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  32.18 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  26.17 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  24.1 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  27.2 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.87 
 
 
643 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  26 
 
 
892 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  26.27 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  29.51 
 
 
346 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  25.39 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  24.42 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  22.49 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  22.97 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  23.72 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  34.46 
 
 
1100 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 
328 aa  62.8  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.28 
 
 
340 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  27.37 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  22.97 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.73 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  22.89 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  23.79 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  27.07 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  22.89 
 
 
339 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  24.91 
 
 
341 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  24.48 
 
 
327 aa  59.3  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 
754 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  23.5 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  22.54 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  25.8 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  25.68 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  24.79 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.96 
 
 
3027 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  23.57 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  22.18 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.64 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  22.18 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.22 
 
 
327 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>