29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3349 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 429 aa  845    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  71.79 
 
 		 429 aa  586  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  32.58 
 
 		 1356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  37.77 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  32.47 
 
 		 504 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  35.63 
 
 		 626 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  31.31 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  36.81 
 
 		 855 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  33.68 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  36.84 
 
 		 681 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  28.22 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  32.63 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  32.94 
 
 		 581 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  30.85 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  31.01 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  28.72 
 
 		 575 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10690  hypothetical protein  31.53 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  27.18 
 
 		 597 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.67 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 		 319 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0286  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.85 
 
 		 439 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00648173 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  27.57 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  28.33 
 
 		 651 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0258  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.27 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 		 651 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  28.5 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  24.17 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1366  von Willebrand factor, type A  35 
 
 		 491 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>