24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2063 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  507  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  34.72 
 
 		 1356 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  32.47 
 
 		 855 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 		 477 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  31.44 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  31.34 
 
 		 575 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  27.91 
 
 		 504 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  31.01 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  31.85 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  31.53 
 
 		 681 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  23.67 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  25.81 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  27.46 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  28.36 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  23.65 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2880  hypothetical protein  26.67 
 
 		 423 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  23.27 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  24.8 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  27.91 
 
 		 597 aa  45.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  31.85 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  30.51 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>