44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0472 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  100 
 
 
403 aa  810    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  54.73 
 
 
401 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  38.16 
 
 
581 aa  173  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  28.81 
 
 
419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  32.41 
 
 
597 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2880  hypothetical protein  33.03 
 
 
423 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  30.35 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 
575 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  29.75 
 
 
429 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 
504 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  26.7 
 
 
855 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  25.76 
 
 
477 aa  73.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  23.04 
 
 
1356 aa  70.1  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  24.3 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  27.75 
 
 
436 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 
461 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
626 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0335  von Willebrand factor, type A  27.01 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  44.26 
 
 
2449 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  23.67 
 
 
251 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1965  hypothetical protein  27.78 
 
 
486 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  30.63 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  34.48 
 
 
319 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  34.48 
 
 
319 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  45.95 
 
 
1594 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  25.4 
 
 
319 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  24.31 
 
 
681 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  27.16 
 
 
706 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  23.58 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 
698 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1882  putative virulence effector protein  27.66 
 
 
452 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  24.79 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  25 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  25.93 
 
 
315 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  24.38 
 
 
524 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  24.27 
 
 
317 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 
316 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  23.5 
 
 
335 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  23.5 
 
 
335 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  23.5 
 
 
335 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  48.65 
 
 
2397 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  24.24 
 
 
625 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  23.56 
 
 
892 aa  42.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>