24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3156 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 575 aa  1102    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  29.46 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  28.63 
 
 		 401 aa  104  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  34.32 
 
 		 581 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  36.21 
 
 		 597 aa  94  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  28.3 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2880  hypothetical protein  29.68 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  32.64 
 
 		 855 aa  73.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  27.53 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  31.34 
 
 		 251 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  32 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  26.52 
 
 		 1356 aa  60.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.98 
 
 		 2449 aa  57  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  36.05 
 
 		 1888 aa  52.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  29.75 
 
 		 2397 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 		 319 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  35.25 
 
 		 436 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>