18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2623 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2880  hypothetical protein  84.16 
 
 		 423 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  850    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  25.88 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  34.68 
 
 		 581 aa  133  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  33.82 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  32.59 
 
 		 597 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  28.3 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 		 504 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  29.46 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  26.72 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  23.65 
 
 		 251 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  22.75 
 
 		 1356 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  25.93 
 
 		 651 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  25.73 
 
 		 855 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  25.31 
 
 		 651 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0335  von Willebrand factor, type A  25.41 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  24.85 
 
 		 316 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>