19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2880 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2880  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  851    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  84.63 
 
 		 419 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  28.71 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  35.16 
 
 		 581 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  33.5 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  30.49 
 
 		 597 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  29.68 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  26.35 
 
 		 504 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  28.05 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0335  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  26.58 
 
 		 251 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 		 477 aa  49.7  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  25.86 
 
 		 698 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  29.46 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  23.35 
 
 		 1356 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  26.09 
 
 		 651 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  27.44 
 
 		 651 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3214  hypothetical protein  25.56 
 
 		 321 aa  43.5  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.496561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>