38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1721 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
1356 aa  2692    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  33.82 
 
 
855 aa  365  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  49.36 
 
 
477 aa  220  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4065  von Willebrand factor, type A  32.58 
 
 
422 aa  182  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  34.87 
 
 
429 aa  127  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  32.58 
 
 
429 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  34.25 
 
 
427 aa  106  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  34.18 
 
 
251 aa  104  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  36.13 
 
 
681 aa  101  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  34.55 
 
 
436 aa  101  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  32.12 
 
 
504 aa  99.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  32.65 
 
 
461 aa  98.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  29.79 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 
626 aa  80.9  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  23.53 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  28.02 
 
 
581 aa  67.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 
327 aa  63.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  28.22 
 
 
597 aa  62  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  26.52 
 
 
575 aa  60.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  21.18 
 
 
401 aa  60.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10690  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  57.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.85 
 
 
442 aa  56.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  29.85 
 
 
543 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  31.65 
 
 
608 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 
334 aa  53.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  24.67 
 
 
315 aa  51.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 
313 aa  49.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  25.6 
 
 
562 aa  48.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  22.75 
 
 
419 aa  48.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 
547 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  24.32 
 
 
319 aa  47.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  26.43 
 
 
307 aa  47.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  29.93 
 
 
421 aa  45.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  29.13 
 
 
546 aa  45.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  25.52 
 
 
329 aa  45.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  21.68 
 
 
315 aa  45.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  24.8 
 
 
561 aa  45.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 
319 aa  45.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>