61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7319 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  100 
 
 
608 aa  1199    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  38.02 
 
 
655 aa  312  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  37.14 
 
 
609 aa  299  9e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  34.25 
 
 
607 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  36.28 
 
 
583 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  33 
 
 
605 aa  256  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  34.14 
 
 
594 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  33.16 
 
 
601 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  32.24 
 
 
814 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  32.33 
 
 
564 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  30.76 
 
 
618 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  33.16 
 
 
515 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
576 aa  207  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  30.58 
 
 
583 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 
587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  30.55 
 
 
596 aa  187  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  29.36 
 
 
647 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  30.42 
 
 
615 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  35.4 
 
 
593 aa  177  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  30.46 
 
 
586 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 
599 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  28.87 
 
 
584 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  29.82 
 
 
587 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  30.8 
 
 
547 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 
583 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  30.09 
 
 
562 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 
609 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  27.19 
 
 
543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.72 
 
 
561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  29.63 
 
 
560 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  25.74 
 
 
550 aa  147  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 
562 aa  144  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  27.89 
 
 
588 aa  143  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  35.03 
 
 
527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  25.05 
 
 
546 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 
547 aa  133  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  28.78 
 
 
596 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  35.18 
 
 
594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  25.41 
 
 
636 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  26.14 
 
 
677 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  23.86 
 
 
685 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  23.86 
 
 
685 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  23.86 
 
 
688 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  25.4 
 
 
589 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  25.15 
 
 
355 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  29.75 
 
 
640 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.53 
 
 
851 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  32.87 
 
 
1356 aa  53.9  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  28.89 
 
 
327 aa  53.5  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  26.9 
 
 
394 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 
633 aa  50.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  25.89 
 
 
570 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  30.6 
 
 
477 aa  49.7  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  32.04 
 
 
368 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 
559 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3488  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 
268 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  32.29 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  29.61 
 
 
224 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  29.94 
 
 
855 aa  45.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0945  von Willebrand factor type A  31.91 
 
 
2166 aa  45.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.775742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  25.13 
 
 
851 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>