More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0181 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 428 aa  877    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.75 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  55.78 
 
 		 417 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38.5 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  55.94 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  53.73 
 
 		 447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  51.24 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  50.5 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  49.04 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  46.04 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  49.75 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.09 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  44.61 
 
 		 314 aa  166  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  47.4 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  43.87 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 543 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.4 
 
 		 542 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  43.93 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.79 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  28.91 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  43.13 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.35 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  42.53 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  46.84 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  46.2 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  47.89 
 
 		 209 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.51 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  37.99 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  33.69 
 
 		 322 aa  126  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 1755 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 727 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  44.97 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  42.14 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  42.14 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 		 458 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  36.24 
 
 		 1987 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.71 
 
 		 345 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.71 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.71 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.71 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.71 
 
 		 344 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.71 
 
 		 344 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.7 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  44.83 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  40.71 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  44.83 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  57.43 
 
 		 1707 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  42.34 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  39.29 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  45.26 
 
 		 335 aa  114  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  38.86 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  49.04 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  47.71 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  49.04 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.54 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  29.47 
 
 		 637 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  34.93 
 
 		 352 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  39.73 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  39.07 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  41.78 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  33.2 
 
 		 490 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  46.79 
 
 		 457 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.1 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  40.69 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  39.16 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  39.16 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  39.31 
 
 		 244 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 623 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 459 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 459 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  38.73 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.07 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  45.19 
 
 		 224 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  38.03 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  35.62 
 
 		 208 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 		 362 aa  100  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 333 aa  99.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  37.32 
 
 		 370 aa  99.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 333 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  52.58 
 
 		 290 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  35.84 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  37.32 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.62 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.44 
 
 		 226 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  44.9 
 
 		 468 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0595  OmpA/MotB  32.28 
 
 		 194 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  37.32 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.32 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  35.33 
 
 		 502 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  32.13 
 
 		 386 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.03 
 
 		 240 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  43.88 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  36.62 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  35.21 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>