200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2317 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 350 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  64.71 
 
 		 354 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  63.77 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  66.86 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  61.89 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  53.37 
 
 		 354 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  51.69 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  47.41 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  33.63 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  34.91 
 
 		 321 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  36.62 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  34.6 
 
 		 327 aa  169  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  33.43 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  39.19 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  35.38 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  36.65 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  32.74 
 
 		 315 aa  159  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  34.38 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  33.67 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  33.78 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  32.78 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  31.86 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  35.26 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  38.44 
 
 		 320 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  35.94 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  33.02 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  33.02 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  33.02 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  32.22 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  36 
 
 		 313 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  34.91 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  36.02 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  35.28 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  33 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  31.77 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  35.26 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  35.44 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  35.74 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  31.46 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  34.27 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  31.3 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  28.84 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  27.67 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  29.85 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  28.85 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  29.49 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  26.76 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  32.58 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  31.73 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  30.38 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  30.24 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  31.38 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  30.06 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  27.24 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  29.84 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  32.12 
 
 		 373 aa  90.5  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  25.26 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.33 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  32.81 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  30.37 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  31.1 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  30.71 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  31.04 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  30.71 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  34.03 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  30.71 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  30.31 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  31.94 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  29.05 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  29.93 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  30.31 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  30.31 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  30.31 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.63 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  34.21 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  26.4 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.32 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.53 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.27 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.63 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  29.32 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  32.05 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  30.31 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  31.08 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  28.92 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  32.35 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  28.2 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  31.47 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  26.54 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  29.92 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  24.21 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  27.96 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  29.64 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>