126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2441 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 609 aa  1235    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  55.28 
 
 		 605 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  55.19 
 
 		 607 aa  658    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  51.22 
 
 		 594 aa  571  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  53.75 
 
 		 583 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  53.39 
 
 		 601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  45.37 
 
 		 618 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  36.29 
 
 		 608 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  36.31 
 
 		 562 aa  290  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  31.3 
 
 		 550 aa  284  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  32.92 
 
 		 543 aa  276  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  32.22 
 
 		 546 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  33.99 
 
 		 647 aa  270  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  32.17 
 
 		 562 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 547 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  33.27 
 
 		 561 aa  266  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  33.16 
 
 		 655 aa  233  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  33.27 
 
 		 596 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 		 599 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  29.04 
 
 		 814 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  30.8 
 
 		 587 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  30.29 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 564 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  28.35 
 
 		 560 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  27.99 
 
 		 576 aa  178  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  27.94 
 
 		 583 aa  174  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 		 609 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  27.19 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  31.04 
 
 		 547 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 		 588 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.06 
 
 		 583 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  28.57 
 
 		 587 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  28.44 
 
 		 584 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  32.73 
 
 		 593 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  28.67 
 
 		 596 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 		 589 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  27.99 
 
 		 594 aa  126  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  34.23 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  27.87 
 
 		 570 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 		 559 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.97 
 
 		 851 aa  94.7  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  28.08 
 
 		 414 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  25.84 
 
 		 536 aa  90.5  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  24.68 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 547 aa  88.2  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  26.91 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  24.3 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  22.84 
 
 		 677 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  30.21 
 
 		 851 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  24.82 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  34.2 
 
 		 842 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 		 847 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  21.78 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.79 
 
 		 442 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  28.64 
 
 		 490 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 		 888 aa  61.2  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2192  hypothetical protein  24.59 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  24.06 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  28.72 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  26.83 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  23.81 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  31.19 
 
 		 795 aa  57.8  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  22.07 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.25 
 
 		 451 aa  57  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  26.58 
 
 		 582 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0945  von Willebrand factor type A  30.34 
 
 		 2166 aa  56.2  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.775742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 		 327 aa  55.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.24 
 
 		 420 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 		 421 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 592 aa  54.3  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2590  FHA domain-containing protein  27.23 
 
 		 785 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  24.76 
 
 		 411 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 		 902 aa  53.9  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  22.47 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  22.47 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  21.3 
 
 		 565 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  30.41 
 
 		 966 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 972 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9022  hypothetical protein  28.61 
 
 		 688 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  20.69 
 
 		 474 aa  51.6  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 626 aa  51.6  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  23.74 
 
 		 462 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  22.3 
 
 		 688 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  24.14 
 
 		 412 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  23.46 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 		 788 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 		 579 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  27.54 
 
 		 654 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  23.5 
 
 		 363 aa  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 		 412 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  21.74 
 
 		 317 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  24.15 
 
 		 436 aa  48.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.03 
 
 		 418 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  25.45 
 
 		 536 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  22.12 
 
 		 602 aa  47.4  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>