98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3821 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  72.13 
 
 
932 aa  1227    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  100 
 
 
936 aa  1835    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  39.3 
 
 
966 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  39.94 
 
 
958 aa  540  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  38.3 
 
 
978 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  38.22 
 
 
972 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  37.15 
 
 
950 aa  508  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  38.1 
 
 
914 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  31.29 
 
 
918 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  34.1 
 
 
951 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  29.27 
 
 
1023 aa  291  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 
902 aa  291  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  31.7 
 
 
847 aa  282  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  32.58 
 
 
851 aa  270  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 
903 aa  263  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 
888 aa  263  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 
828 aa  259  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  29.1 
 
 
842 aa  223  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 
859 aa  163  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 
744 aa  112  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 
717 aa  93.6  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  24.69 
 
 
789 aa  78.2  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  28.49 
 
 
571 aa  77  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  22.92 
 
 
813 aa  70.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  29.24 
 
 
474 aa  69.7  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  30.51 
 
 
419 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  29.12 
 
 
761 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  23.91 
 
 
418 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  29.12 
 
 
761 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  25 
 
 
788 aa  56.6  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  29.12 
 
 
761 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 
328 aa  57  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  30.27 
 
 
759 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  24.75 
 
 
415 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 
393 aa  54.7  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 
1188 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  22.44 
 
 
459 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.77 
 
 
420 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.77 
 
 
442 aa  52.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  24.54 
 
 
640 aa  52.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 
421 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  25.45 
 
 
328 aa  52.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 
412 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  25.77 
 
 
325 aa  52.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  25.53 
 
 
536 aa  51.6  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  30 
 
 
248 aa  51.6  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25.76 
 
 
419 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 
347 aa  51.2  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  25.61 
 
 
350 aa  50.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  25.9 
 
 
613 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  25.86 
 
 
627 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  29.11 
 
 
686 aa  50.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 
412 aa  50.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  24.72 
 
 
412 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.45 
 
 
621 aa  50.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 
592 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  28.96 
 
 
282 aa  50.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  24.17 
 
 
642 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  27.83 
 
 
436 aa  48.9  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 
610 aa  48.9  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  22.01 
 
 
416 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  25.15 
 
 
625 aa  48.1  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  25.15 
 
 
624 aa  48.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  26.11 
 
 
651 aa  48.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  26 
 
 
625 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.59 
 
 
451 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  23.87 
 
 
639 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  25.79 
 
 
651 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  25 
 
 
335 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  25.29 
 
 
642 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  31.69 
 
 
325 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  27.03 
 
 
335 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 
792 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  26.26 
 
 
562 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  25.99 
 
 
796 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  27.03 
 
 
335 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  27.03 
 
 
335 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.26 
 
 
421 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  25.76 
 
 
342 aa  46.2  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  24.09 
 
 
427 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  29.27 
 
 
618 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 
411 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  25.5 
 
 
335 aa  45.8  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 
340 aa  45.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
588 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  31.67 
 
 
1077 aa  45.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.75 
 
 
751 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  32.97 
 
 
252 aa  45.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  25.77 
 
 
642 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  36.36 
 
 
829 aa  45.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  29.45 
 
 
419 aa  45.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  44.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  25.96 
 
 
334 aa  44.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.41 
 
 
759 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 
418 aa  44.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  24.51 
 
 
418 aa  44.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  21.99 
 
 
698 aa  44.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>