190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2244 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
416 aa  845    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  35.58 
 
 
462 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  34.44 
 
 
411 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  33.98 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  35.49 
 
 
615 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.36 
 
 
442 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.96 
 
 
460 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  31.96 
 
 
472 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.68 
 
 
472 aa  166  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.88 
 
 
451 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 
419 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  29.85 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 
480 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.29 
 
 
420 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 
430 aa  142  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  30.2 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.82 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  30.28 
 
 
423 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  31.35 
 
 
419 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  29.19 
 
 
425 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  28.42 
 
 
419 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  29.57 
 
 
418 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.25 
 
 
415 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 
425 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  33.47 
 
 
459 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  34.69 
 
 
610 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  32.3 
 
 
505 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  26.33 
 
 
523 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
421 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 
418 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  31.9 
 
 
566 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 
418 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 
418 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 
412 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  29.78 
 
 
593 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  31.75 
 
 
490 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  29.67 
 
 
598 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  31.9 
 
 
563 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  30.91 
 
 
575 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  25.61 
 
 
602 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.91 
 
 
575 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.91 
 
 
588 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 
426 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 
642 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  30.41 
 
 
633 aa  96.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  31.36 
 
 
642 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  31.36 
 
 
627 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  30.84 
 
 
350 aa  96.3  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.33 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
642 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 
808 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 
792 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  29.95 
 
 
625 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  26.82 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.98 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  29.49 
 
 
613 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  28.38 
 
 
686 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  29.49 
 
 
624 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  29.96 
 
 
446 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 
393 aa  90.5  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  29.74 
 
 
592 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  35.68 
 
 
966 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  26.76 
 
 
571 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  28.09 
 
 
629 aa  87  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 
625 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  26.49 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 
651 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.57 
 
 
621 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  27.19 
 
 
651 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
536 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
639 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 
551 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  33.7 
 
 
951 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  27.3 
 
 
555 aa  82  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 
500 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 
640 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  34.05 
 
 
972 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  29.6 
 
 
612 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 
903 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 
859 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 
555 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  24.06 
 
 
464 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.34 
 
 
759 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  29.79 
 
 
706 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.41 
 
 
812 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 
918 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  29.33 
 
 
958 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  29.08 
 
 
914 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 
523 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  29.74 
 
 
847 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 
842 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 
828 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 
654 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.63 
 
 
751 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 
698 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.63 
 
 
755 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>