163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5984 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 654 aa  1263    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  56.52 
 
 		 708 aa  529  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  52.55 
 
 		 698 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  52.54 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  54.61 
 
 		 592 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  50.29 
 
 		 651 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  49.71 
 
 		 651 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  47.29 
 
 		 642 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  47.29 
 
 		 642 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  47.08 
 
 		 627 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  45.5 
 
 		 686 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  46.04 
 
 		 642 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  51.1 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  47.54 
 
 		 613 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  45.84 
 
 		 633 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  49.25 
 
 		 625 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  49.79 
 
 		 563 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  47.12 
 
 		 625 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.47 
 
 		 621 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  46.7 
 
 		 624 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  44.7 
 
 		 612 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  48.03 
 
 		 536 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  46.39 
 
 		 640 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  49.69 
 
 		 792 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  48.77 
 
 		 566 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  45.26 
 
 		 639 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  42.28 
 
 		 571 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  42.97 
 
 		 588 aa  385  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  44.1 
 
 		 598 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  44.1 
 
 		 593 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  45.32 
 
 		 613 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  42.65 
 
 		 575 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  42.65 
 
 		 575 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  43.1 
 
 		 709 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  43.17 
 
 		 551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  38.67 
 
 		 629 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  48.3 
 
 		 555 aa  306  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  39.61 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  49.84 
 
 		 350 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  37.07 
 
 		 610 aa  283  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  39.61 
 
 		 490 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  35.53 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 		 859 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  34.86 
 
 		 935 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.24 
 
 		 451 aa  87.4  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.59 
 
 		 460 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.59 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  22.59 
 
 		 472 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.53 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 		 808 aa  84  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  26.58 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  29.59 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  30.5 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  30.57 
 
 		 602 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.08 
 
 		 418 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 		 462 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  31.49 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  28.31 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.5 
 
 		 418 aa  63.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  29.83 
 
 		 589 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  29.06 
 
 		 966 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.11 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  26.46 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  34.59 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.12 
 
 		 680 aa  57.4  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  26.26 
 
 		 412 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 842 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 412 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  28.38 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  28.75 
 
 		 464 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  31.84 
 
 		 421 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 		 418 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  33.33 
 
 		 660 aa  53.5  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  31.01 
 
 		 316 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  31.34 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.05 
 
 		 673 aa  52.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.52 
 
 		 688 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  29.27 
 
 		 582 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  28.34 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 		 505 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  33.72 
 
 		 92 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29.6 
 
 		 344 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 		 918 aa  50.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  32.57 
 
 		 315 aa  51.2  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  40.37 
 
 		 670 aa  50.8  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.68 
 
 		 653 aa  50.8  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.54 
 
 		 755 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  27.08 
 
 		 669 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.54 
 
 		 751 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>