24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2086 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  100 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  43.48 
 
 		 613 aa  80.1  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  38.89 
 
 		 625 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  40.7 
 
 		 639 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  37.78 
 
 		 792 aa  60.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  38.82 
 
 		 709 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.27 
 
 		 588 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  37.04 
 
 		 575 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.04 
 
 		 575 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  37.21 
 
 		 536 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  36.78 
 
 		 593 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  36.78 
 
 		 598 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 		 588 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  32.97 
 
 		 612 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  31.46 
 
 		 686 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  33.72 
 
 		 551 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  32.18 
 
 		 640 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  34.88 
 
 		 563 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.22 
 
 		 621 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 592 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  32.22 
 
 		 613 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  31.11 
 
 		 633 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  31.11 
 
 		 625 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  31.11 
 
 		 624 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>