227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3424 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  100 
 
 
592 aa  1182    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  55.95 
 
 
555 aa  512  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  55.65 
 
 
651 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  55.02 
 
 
651 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  54.68 
 
 
698 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  50.57 
 
 
706 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  54.95 
 
 
708 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  48.69 
 
 
563 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  52.53 
 
 
686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  48.84 
 
 
640 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  50.92 
 
 
566 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  48.79 
 
 
625 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  54.44 
 
 
654 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  43.05 
 
 
642 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  48.64 
 
 
625 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  44.51 
 
 
639 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  48.43 
 
 
624 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  47.67 
 
 
627 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  47.46 
 
 
642 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  47.81 
 
 
613 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.17 
 
 
621 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  42.54 
 
 
642 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  45.55 
 
 
575 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  45.55 
 
 
575 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  46.09 
 
 
612 aa  425  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  40.83 
 
 
633 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.43 
 
 
588 aa  425  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  46.15 
 
 
613 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  41.5 
 
 
571 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  46.85 
 
 
536 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  45.49 
 
 
598 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  45.7 
 
 
593 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  45.51 
 
 
792 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  44.63 
 
 
709 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  43.4 
 
 
551 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  40.82 
 
 
555 aa  306  5.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  42.03 
 
 
629 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  48.08 
 
 
350 aa  291  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  34.96 
 
 
610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  37.97 
 
 
588 aa  282  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  36.98 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  35.44 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 
859 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  34.94 
 
 
935 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.83 
 
 
451 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  31 
 
 
615 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  34.78 
 
 
462 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 
808 aa  93.6  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.03 
 
 
460 aa  92  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 
472 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.62 
 
 
472 aa  89.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.74 
 
 
416 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 
419 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.28 
 
 
411 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.19 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 
425 aa  84  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.57 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  29.21 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  24.65 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  32.71 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  28.64 
 
 
701 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.55 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  30.95 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  24.45 
 
 
602 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  24.46 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  25.25 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.13 
 
 
751 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.66 
 
 
755 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 
418 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.61 
 
 
412 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  31.79 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.44 
 
 
759 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
418 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 
412 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
415 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
418 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  36.94 
 
 
670 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
505 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  27.16 
 
 
816 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  25.83 
 
 
523 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  32.8 
 
 
966 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  28.37 
 
 
771 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.88 
 
 
412 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  34.43 
 
 
523 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.24 
 
 
772 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.91 
 
 
772 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  31.21 
 
 
660 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  27.14 
 
 
760 aa  58.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 
589 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.76 
 
 
680 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  25.45 
 
 
750 aa  57.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  27.88 
 
 
757 aa  57.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 
446 aa  57.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 
329 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>