139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2973 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  81.26 
 
 		 621 aa  994    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 624 aa  1275    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  99.52 
 
 		 625 aa  1268    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  56.97 
 
 		 612 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  91.67 
 
 		 613 aa  1159    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  70.22 
 
 		 642 aa  834    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  70.68 
 
 		 633 aa  880    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  70.22 
 
 		 642 aa  837    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  70.55 
 
 		 642 aa  841    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  69.64 
 
 		 640 aa  691    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  70.22 
 
 		 627 aa  837    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  48.31 
 
 		 563 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  53.8 
 
 		 566 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  47.48 
 
 		 625 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  43.47 
 
 		 698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  47.49 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  48.81 
 
 		 613 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  45.62 
 
 		 706 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  43.19 
 
 		 708 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  52.31 
 
 		 536 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  48.43 
 
 		 592 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  48.4 
 
 		 651 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  47.97 
 
 		 651 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  46.83 
 
 		 792 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.42 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  47.5 
 
 		 639 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  47.02 
 
 		 686 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  47.22 
 
 		 709 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  47.61 
 
 		 551 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  47.39 
 
 		 555 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  43.37 
 
 		 575 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  43.37 
 
 		 575 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  46.61 
 
 		 654 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  43.96 
 
 		 598 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  43.96 
 
 		 593 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  43.61 
 
 		 629 aa  344  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  50.15 
 
 		 350 aa  327  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  41.2 
 
 		 555 aa  312  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  40.61 
 
 		 588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  43.8 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  42.69 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  37.64 
 
 		 500 aa  247  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 859 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 		 935 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.69 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  33.01 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.49 
 
 		 416 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.11 
 
 		 460 aa  88.2  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 		 472 aa  87.8  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 		 425 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  33.16 
 
 		 615 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.61 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  29.22 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  31.12 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.67 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.19 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 		 808 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  23.47 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  31.05 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 		 430 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.08 
 
 		 459 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.62 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.86 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  31.29 
 
 		 418 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  31.06 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  25.11 
 
 		 602 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.55 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.08 
 
 		 680 aa  63.9  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  31.68 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  23.08 
 
 		 701 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  29.33 
 
 		 789 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01615  hypothetical protein  43.04 
 
 		 86 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  31.07 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  29.45 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  23.43 
 
 		 592 aa  57.4  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  27.54 
 
 		 418 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  26.87 
 
 		 441 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  25.89 
 
 		 505 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 		 966 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.81 
 
 		 3027 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  27.88 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 		 419 aa  54.7  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 		 1188 aa  54.3  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 		 393 aa  54.3  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.54 
 
 		 755 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.54 
 
 		 759 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.54 
 
 		 420 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.3 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 		 914 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 		 589 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>