152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1387 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  100 
 
 
575 aa  1178    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 
575 aa  1178    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  90.48 
 
 
588 aa  1066    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  61.43 
 
 
598 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  60.13 
 
 
593 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  50.22 
 
 
563 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  44.72 
 
 
571 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  52.35 
 
 
566 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  42.86 
 
 
642 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  42.41 
 
 
642 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  42.86 
 
 
627 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  42.07 
 
 
642 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  47.96 
 
 
640 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  40 
 
 
613 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  39.12 
 
 
625 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  45.34 
 
 
592 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.87 
 
 
621 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  38.95 
 
 
624 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  40.3 
 
 
633 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  44.44 
 
 
625 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  40.57 
 
 
698 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  45.97 
 
 
639 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  45.74 
 
 
536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  40.93 
 
 
706 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  44.18 
 
 
686 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  45.78 
 
 
613 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  37.33 
 
 
612 aa  395  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  43.84 
 
 
792 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  41.94 
 
 
651 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  41.94 
 
 
651 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  44.68 
 
 
709 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  44.98 
 
 
708 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  44.16 
 
 
555 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  40.64 
 
 
551 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  40.27 
 
 
654 aa  351  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  53.69 
 
 
350 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  39.59 
 
 
629 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  36.49 
 
 
555 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  37.92 
 
 
588 aa  274  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  33.4 
 
 
610 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  34.02 
 
 
500 aa  213  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  32.88 
 
 
490 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 
859 aa  154  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  35 
 
 
935 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  35.08 
 
 
462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  30.91 
 
 
416 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.14 
 
 
479 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 
425 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 
430 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 
412 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.96 
 
 
460 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.46 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  26.96 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.96 
 
 
472 aa  84  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 
425 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.77 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  29.49 
 
 
615 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  25.4 
 
 
808 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  24.81 
 
 
419 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.61 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  23.49 
 
 
411 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  26.43 
 
 
602 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  31.98 
 
 
426 aa  76.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  29.56 
 
 
459 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  31.74 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  27 
 
 
427 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  31.29 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  32.88 
 
 
523 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 
418 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  25.66 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 
505 aa  68.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.13 
 
 
412 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  30.18 
 
 
418 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
418 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
418 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  23.86 
 
 
415 aa  63.9  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  30.4 
 
 
523 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  25.24 
 
 
701 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  25.48 
 
 
760 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  23.79 
 
 
452 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.64 
 
 
755 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 
421 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  33.72 
 
 
1100 aa  57.4  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  24.78 
 
 
816 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.48 
 
 
759 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  21.59 
 
 
452 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  26.8 
 
 
739 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  37.04 
 
 
92 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.64 
 
 
751 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  22.46 
 
 
412 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  24.08 
 
 
335 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  22.73 
 
 
393 aa  54.7  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  24.07 
 
 
419 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  23.01 
 
 
763 aa  53.9  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  23.76 
 
 
480 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  32.17 
 
 
477 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  27.22 
 
 
441 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>