145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3075 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 536 aa  1081    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  60.97 
 
 		 625 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  58.94 
 
 		 639 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  62.21 
 
 		 613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  57.42 
 
 		 551 aa  538  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  57.78 
 
 		 709 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  51.33 
 
 		 792 aa  479  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  52.58 
 
 		 563 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  51.28 
 
 		 566 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  47.52 
 
 		 571 aa  455  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  53.32 
 
 		 621 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  52.62 
 
 		 613 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  54.42 
 
 		 640 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  54.51 
 
 		 627 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  54.29 
 
 		 642 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  54.51 
 
 		 642 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  50 
 
 		 706 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  52.53 
 
 		 625 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  53.85 
 
 		 642 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  53.1 
 
 		 633 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  52.31 
 
 		 624 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  49.04 
 
 		 651 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  49.04 
 
 		 651 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  49.79 
 
 		 698 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  46.22 
 
 		 612 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  49.06 
 
 		 708 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  45.85 
 
 		 598 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  45.85 
 
 		 593 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  48.28 
 
 		 629 aa  413  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  46.85 
 
 		 592 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  46.2 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.2 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.23 
 
 		 588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  47.69 
 
 		 555 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  48.15 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  47.08 
 
 		 654 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  44.73 
 
 		 555 aa  399  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  43.78 
 
 		 686 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  53.22 
 
 		 350 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  37.53 
 
 		 610 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  35.41 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  38.25 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  29.12 
 
 		 859 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  38.86 
 
 		 935 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.32 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.64 
 
 		 451 aa  101  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  25.84 
 
 		 419 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  31.19 
 
 		 425 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.33 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  30.69 
 
 		 425 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 		 472 aa  87.8  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.9 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  30.29 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 808 aa  80.9  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  31.77 
 
 		 615 aa  80.5  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  27.07 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  23.91 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  31.36 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  32.95 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  30.32 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  30.85 
 
 		 705 aa  63.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  26.03 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.78 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  30.96 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  28.98 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  24.63 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  26.74 
 
 		 932 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 		 418 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.72 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.27 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  31.03 
 
 		 317 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 		 958 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  22.81 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  27.62 
 
 		 701 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 		 523 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.74 
 
 		 673 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  37.21 
 
 		 92 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  24.74 
 
 		 412 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  30.24 
 
 		 914 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  24.74 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  22.91 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  27.08 
 
 		 918 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 		 936 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  23.76 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  29.26 
 
 		 776 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  36.08 
 
 		 670 aa  51.2  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  30.82 
 
 		 327 aa  50.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>