115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0263 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 551 aa  1122    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  57.42 
 
 		 536 aa  538  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  52 
 
 		 625 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  53.09 
 
 		 613 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  51.17 
 
 		 639 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  49.59 
 
 		 629 aa  450  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  49.04 
 
 		 563 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  50.43 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  49.57 
 
 		 709 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  52.09 
 
 		 640 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  43.45 
 
 		 642 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  43.65 
 
 		 613 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  49.57 
 
 		 633 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  46.43 
 
 		 792 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  47.82 
 
 		 625 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  47.35 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  43.24 
 
 		 642 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  43.09 
 
 		 627 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  47.61 
 
 		 624 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  48.18 
 
 		 621 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  42.52 
 
 		 642 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  44.68 
 
 		 612 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  47.11 
 
 		 698 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  46.33 
 
 		 706 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  44.56 
 
 		 571 aa  385  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  45.7 
 
 		 686 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  43.4 
 
 		 592 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  43.78 
 
 		 651 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  43.99 
 
 		 651 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  41.35 
 
 		 588 aa  357  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  46.07 
 
 		 555 aa  352  8e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  41.25 
 
 		 598 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  40.64 
 
 		 575 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.64 
 
 		 575 aa  351  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  40.99 
 
 		 593 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  42.03 
 
 		 654 aa  337  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  43.16 
 
 		 708 aa  333  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  42.15 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  53.08 
 
 		 350 aa  315  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  35.54 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  38.02 
 
 		 490 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  37.88 
 
 		 500 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 		 859 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  38.41 
 
 		 935 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.64 
 
 		 451 aa  94.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 462 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.64 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.49 
 
 		 416 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.18 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  32.31 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  29.29 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.29 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  22.04 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.04 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  25.73 
 
 		 421 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  21.67 
 
 		 808 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  23.78 
 
 		 418 aa  67  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  28.65 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  27.93 
 
 		 427 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.74 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  22.86 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.92 
 
 		 459 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 		 423 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  25.11 
 
 		 669 aa  60.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  29.21 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  27.53 
 
 		 914 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  24.89 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  28.36 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 		 418 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  29.11 
 
 		 523 aa  57  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 		 505 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  27.66 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.62 
 
 		 420 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  28.23 
 
 		 582 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.34 
 
 		 673 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  30.54 
 
 		 828 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.19 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  28.82 
 
 		 705 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  22.73 
 
 		 903 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  27.32 
 
 		 966 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  28.19 
 
 		 776 aa  48.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.35 
 
 		 680 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  23.12 
 
 		 816 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.58 
 
 		 674 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  33.72 
 
 		 92 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  23.76 
 
 		 523 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  25.69 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  27.13 
 
 		 650 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.77 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.74 
 
 		 691 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  27.1 
 
 		 711 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>