More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0187 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 613 aa  1247    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  56.1 
 
 		 625 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  54.15 
 
 		 639 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  62.21 
 
 		 536 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  60.81 
 
 		 709 aa  558  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  51.12 
 
 		 792 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  53.21 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  50.39 
 
 		 640 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  49.9 
 
 		 621 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  49.01 
 
 		 625 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  49.03 
 
 		 613 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  49.89 
 
 		 566 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  48.81 
 
 		 624 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  49.8 
 
 		 633 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  48.18 
 
 		 563 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  49.4 
 
 		 642 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  49.4 
 
 		 627 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  46.76 
 
 		 612 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  49.21 
 
 		 642 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  49.01 
 
 		 642 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  46.15 
 
 		 592 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  45.04 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  46.97 
 
 		 598 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  46.97 
 
 		 593 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  46.2 
 
 		 698 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  47.47 
 
 		 706 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  44.07 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  48.76 
 
 		 708 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  44.63 
 
 		 651 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  44.42 
 
 		 651 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  45.49 
 
 		 588 aa  422  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  45.78 
 
 		 575 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  43.97 
 
 		 686 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  45.78 
 
 		 575 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  45.58 
 
 		 555 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  45.29 
 
 		 629 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  45.89 
 
 		 555 aa  389  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  45.32 
 
 		 654 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  51.83 
 
 		 350 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  38.17 
 
 		 610 aa  296  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  34.38 
 
 		 490 aa  236  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  33.63 
 
 		 500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 		 859 aa  167  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  38.17 
 
 		 935 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.23 
 
 		 451 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  27.86 
 
 		 412 aa  90.1  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  44.35 
 
 		 1013 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  42.45 
 
 		 1076 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  46.46 
 
 		 1017 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  44.64 
 
 		 1095 aa  88.2  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 		 1026 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 1085 aa  84.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  42.57 
 
 		 1076 aa  84  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 1047 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.48 
 
 		 442 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 1038 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1106 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  42.42 
 
 		 1037 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  38.94 
 
 		 1082 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  42.86 
 
 		 1047 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  43.3 
 
 		 1084 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1062 aa  80.5  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  40.78 
 
 		 1019 aa  80.5  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  42.86 
 
 		 1124 aa  80.5  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  43.48 
 
 		 92 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1048 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  40.19 
 
 		 1104 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  42.48 
 
 		 1006 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  41.35 
 
 		 971 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  40.71 
 
 		 1035 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  39.82 
 
 		 1051 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1051 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 1000 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.6 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  39.83 
 
 		 1065 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 1146 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  42.57 
 
 		 1161 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  38.66 
 
 		 1020 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  43.69 
 
 		 1155 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  45.36 
 
 		 1014 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  43.14 
 
 		 1155 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1137 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.6 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.6 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  39.39 
 
 		 1034 aa  77  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  38.39 
 
 		 1028 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  42.42 
 
 		 1064 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  39.81 
 
 		 1179 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  38.35 
 
 		 1058 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.61 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  31.31 
 
 		 523 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  42.48 
 
 		 1115 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  43.88 
 
 		 1010 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  40.35 
 
 		 994 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  37.62 
 
 		 1114 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1010 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  40.82 
 
 		 1168 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  38.61 
 
 		 1102 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  39.32 
 
 		 1139 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>