86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6385 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  100 
 
 
523 aa  1045    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  28.71 
 
 
592 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  25 
 
 
602 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  30.4 
 
 
651 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  30.04 
 
 
651 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2998  hypothetical protein  41.1 
 
 
147 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.222124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  30.88 
 
 
686 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  32.83 
 
 
792 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  28.21 
 
 
566 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  27.59 
 
 
416 aa  94  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 
563 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  29.02 
 
 
639 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  34.67 
 
 
350 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 
592 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.87 
 
 
588 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  32 
 
 
575 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32 
 
 
575 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  31.12 
 
 
555 aa  89  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  32.59 
 
 
613 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  26.26 
 
 
571 aa  87.4  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  35.16 
 
 
490 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  31.62 
 
 
610 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  28.01 
 
 
593 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  28.11 
 
 
598 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  25.79 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
698 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  29.33 
 
 
613 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  32.63 
 
 
629 aa  83.2  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 
654 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  29.6 
 
 
706 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  28.89 
 
 
625 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  29.78 
 
 
709 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  28.19 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  29.18 
 
 
551 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 
612 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  27.47 
 
 
625 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 
627 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.2 
 
 
621 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  27.9 
 
 
642 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  27.56 
 
 
536 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  27.9 
 
 
642 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  33.78 
 
 
555 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 
430 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  22.61 
 
 
615 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  27.9 
 
 
642 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  32.93 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.36 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  28.83 
 
 
640 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  26.89 
 
 
708 aa  67.8  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  25.72 
 
 
633 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.1 
 
 
459 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
505 aa  63.9  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 
425 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.68 
 
 
412 aa  57  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  29.95 
 
 
588 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  25.71 
 
 
425 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.41 
 
 
451 aa  53.9  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  29.12 
 
 
441 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  20.88 
 
 
442 aa  53.5  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  23.48 
 
 
418 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  22.64 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
480 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  23.72 
 
 
808 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  29.56 
 
 
464 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 
935 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 
418 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 
421 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 
418 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  21.82 
 
 
423 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 
418 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 
914 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.31 
 
 
460 aa  47  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0484  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.53 
 
 
622 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.417075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 
446 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  21.31 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.26 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  24.38 
 
 
467 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  30 
 
 
2588 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.23 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
1446 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
452 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 
477 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  21.83 
 
 
966 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 
412 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 
415 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>