145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3544 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  45.78 
 
 		 914 aa  637    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 966 aa  1885    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  84.38 
 
 		 972 aa  1527    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  42.9 
 
 		 958 aa  632  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  40.37 
 
 		 950 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  39.4 
 
 		 936 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  39.02 
 
 		 932 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  36.1 
 
 		 978 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  33.04 
 
 		 951 aa  442  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  32.64 
 
 		 918 aa  399  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 		 902 aa  346  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 		 903 aa  326  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  30.15 
 
 		 851 aa  318  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 		 888 aa  314  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  33.29 
 
 		 828 aa  312  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  33.67 
 
 		 842 aa  303  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  30.21 
 
 		 847 aa  303  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  28.29 
 
 		 1023 aa  302  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  26.68 
 
 		 859 aa  182  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  29.64 
 
 		 744 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 717 aa  102  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  35.68 
 
 		 416 aa  88.6  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  24.66 
 
 		 813 aa  87  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  34.55 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  25.46 
 
 		 788 aa  82  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.87 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  31.46 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  32.59 
 
 		 459 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  31.46 
 
 		 415 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  32.98 
 
 		 1188 aa  71.6  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  28.97 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  30.89 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  23.91 
 
 		 789 aa  67  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  28.37 
 
 		 479 aa  67  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  31.71 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  32.96 
 
 		 610 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 		 462 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  33.18 
 
 		 605 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 		 808 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  32.6 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  27.81 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  31.32 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  30.56 
 
 		 613 aa  59.3  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 		 592 aa  59.3  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  34.07 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  30.5 
 
 		 686 aa  58.2  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  32.12 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  28.98 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 625 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  27.1 
 
 		 571 aa  57.4  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 		 423 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  27.52 
 
 		 640 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 		 654 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.44 
 
 		 425 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 		 418 aa  56.6  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 		 624 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  29.78 
 
 		 419 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 		 625 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.53 
 
 		 643 aa  55.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  30.22 
 
 		 419 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  25.57 
 
 		 629 aa  55.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  37.61 
 
 		 251 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.98 
 
 		 418 aa  55.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 642 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 		 505 aa  55.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.75 
 
 		 421 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  28.98 
 
 		 420 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  32.45 
 
 		 555 aa  54.7  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  32.79 
 
 		 618 aa  54.7  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 642 aa  54.7  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 627 aa  54.7  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.44 
 
 		 621 aa  53.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  30.37 
 
 		 651 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  29.84 
 
 		 651 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  28.65 
 
 		 633 aa  53.5  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  28.34 
 
 		 566 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.22 
 
 		 425 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  30.41 
 
 		 609 aa  53.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  29.26 
 
 		 787 aa  52.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  26.97 
 
 		 412 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 		 792 aa  52.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  26.37 
 
 		 467 aa  52.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  32.32 
 
 		 423 aa  52.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  30.39 
 
 		 418 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 642 aa  52  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.91 
 
 		 588 aa  52  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  26.91 
 
 		 412 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  37.66 
 
 		 252 aa  51.2  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  29.86 
 
 		 601 aa  51.2  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.42 
 
 		 412 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  26.76 
 
 		 598 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  26.76 
 
 		 593 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  27.36 
 
 		 612 aa  50.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 611 aa  50.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  29.61 
 
 		 563 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  30.26 
 
 		 324 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>