100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1287 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  67 
 
 
717 aa  880    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  100 
 
 
744 aa  1442    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 
842 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  29.64 
 
 
966 aa  131  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  29.31 
 
 
847 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  29.43 
 
 
851 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
918 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  30 
 
 
888 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 
972 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 
828 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  26.8 
 
 
932 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  26.03 
 
 
902 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 
936 aa  111  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.62 
 
 
903 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  28.4 
 
 
951 aa  110  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 
958 aa  104  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  32.38 
 
 
914 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  24.76 
 
 
1023 aa  87.8  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  24.58 
 
 
950 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 
412 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  34.97 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  23.93 
 
 
859 aa  69.7  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  25.72 
 
 
978 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  32.2 
 
 
430 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  29.53 
 
 
393 aa  64.3  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  35.71 
 
 
561 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
474 aa  61.2  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  24.76 
 
 
813 aa  60.8  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  33.77 
 
 
547 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.36 
 
 
442 aa  58.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  29.89 
 
 
490 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 
419 aa  57.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  32.92 
 
 
562 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 
795 aa  57.4  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 
316 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.22 
 
 
671 aa  57  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  22 
 
 
571 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  24.73 
 
 
643 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.75 
 
 
771 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.01 
 
 
751 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.65 
 
 
759 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.59 
 
 
786 aa  54.7  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
356 aa  54.7  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  31.45 
 
 
711 aa  54.7  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.01 
 
 
755 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  27.88 
 
 
330 aa  54.3  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.01 
 
 
420 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  31.85 
 
 
753 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.75 
 
 
772 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  30.67 
 
 
317 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  31.13 
 
 
543 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  26.59 
 
 
416 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 
607 aa  52  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  24.63 
 
 
316 aa  51.6  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 
419 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.9 
 
 
776 aa  51.2  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.63 
 
 
427 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  25.39 
 
 
788 aa  50.8  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  28.83 
 
 
701 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  24.19 
 
 
459 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 
411 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.11 
 
 
772 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.15 
 
 
479 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.85 
 
 
729 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 
307 aa  50.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  24.03 
 
 
426 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.01 
 
 
701 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  24.08 
 
 
789 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.48 
 
 
712 aa  49.3  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 
421 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  21.78 
 
 
610 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.19 
 
 
338 aa  48.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  33.61 
 
 
602 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  28.48 
 
 
771 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  29.34 
 
 
563 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  29.55 
 
 
523 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  28.4 
 
 
566 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.32 
 
 
327 aa  47.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 
550 aa  47.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  26.14 
 
 
789 aa  47.4  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 
546 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.98 
 
 
691 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  26.77 
 
 
412 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 
342 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  29.35 
 
 
344 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 
336 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.75 
 
 
760 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 
332 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  27.39 
 
 
757 aa  45.8  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 
418 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.86 
 
 
344 aa  45.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  32.93 
 
 
344 aa  45.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.83 
 
 
812 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1710  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 
698 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  26.55 
 
 
350 aa  44.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.52 
 
 
763 aa  44.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 
592 aa  44.3  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  26.84 
 
 
555 aa  44.3  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.51 
 
 
722 aa  43.9  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>